1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
на первую страницукарта сайта обратная связь

Содержание



  1. О создании Центра
  2. Цели и основные направления деятельности
  3. Структура и ресурсы
  4. Гранты, контракты, договоры (2001-2004 гг.)
  5. Работы Центра

    1. Исследования углеродных наносистем и нанобионика
    2. Проект CRDF "Advanced Nanotechnologies"
    3. Прецизионная физика атомных систем
    4. Суперкомпьютерные вычислительные технологии и их применение
    5. Вычислительное моделирование уникальных технических устройств
    6. Компьютерная биология





Компьютерная биология


В направлении компьютерной биологии осуществляются как фундаментальные исследования, так и разработка компьютерных приложений для поддержки биологических исследований. В настоящее время существуют следующие направления деятельности:


  • исследование структуры, функции и эволюции генных сетей;
  • создание баз данных по молекулярной биологии и разработка новых эффективных методов обработки и хранения данных;
  • разработка методов получения данных по экспрессии генов.




Двумерный интегрированный атлас экспрессии генов Kr (зеленый), gt
(синий), eve (красный) для 8-го временного класса. Интегрированные картины
экспрессии трех генов наложены на ядерную модель двумерного паттерна.
Определение возраста эмбриона по его картине экспрессии.




Рассматривается крайне актуальная для современной биологии и медицины проблема – изучение механизмов функционирования генов с использованием современных математических методов моделирования генных сетей. В качестве объекта исследования выбран традиционный модельный биологический организм – плодовая мушка дрозофила.

На основании результатов исследования создана открытая онлайновая база данных, которая содержит:


  • картины экспрессии генов (Иллюстрация)
  • количественные данные об экспрессии генов во времени и пространстве;
  • результаты моделирования экспрессии генов.


Данное исследование позволяет понять механизмы функционирования генов в генных сетях, т.е. ответить на основной вопрос функциональной геномики крайне актуального для медицины будущего современного направления молекулярной биологии. В перспективе эти исследования позволят целенаправленно создавать лекарства для каждого пациента (перейти к индивидуальной фармакологии), выяснять механизмы болезней, научиться корректировать генетические ошибки, лечить такие болезни как рак и СПИД.

Исследования проводятся совместно с американскими учеными из Университета штата Нью-Йорк и Лос-Аламосской Национальной лаборатории США по многолетней программе национального института здоровья США.

Организован и действует санкт-петербургский городской семинар по компьютерной биологии (руководитель М. Г. Самсонова).


Деятельность | Обучение| Структура| Контакты
Партнёры| Семинары| Сайт СпбГПУ


(c)ЦПИ СПбГПУ (2001-2007)
Designed by Denis Orlov (2004-2005)
Rambler's Top100 Rambler's Top100